WonderWitch 是由 Qute 公司开发、万代（Bandai）于 2000 年推出的官方开发套件，旨在让个人开发者为 WonderSwan 掌上游戏机编写软件。该套件包含专用的可重写卡带，内置 FreyaOS 操作系统，支持 C 语言编程。尽管售价较高，但它为编程爱好者提供了一个在掌机上实现创意的平台。通过 WonderWitch，开发者能够创建各种应用程序和游戏，部分作品甚至达到了商业发行的水平。例如，在 2001 年的 WonderWitch 编程大赛（WWGP2001）中，M-KAI 团队的《JUDGEMENT SILVERSWORD》荣获大奖，并随后商品化。此外，WonderWitch 还支持多次更新，以适应 WonderSwan Color 等新硬件，并增加对 Windows XP 的支持。尽管需要一定的编程技能，但 WonderWitch 的推出极大地丰富了 WonderSwan 的软件生态，吸引了众多独立开发者的参与。